Protein–RNA interactions for Protein: O60830

TIMM17B, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17-B, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17BO60830 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TIMM17BO60830 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TIMM17BO60830 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TIMM17BO60830 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TIMM17BO60830 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TIMM17BO60830 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TIMM17BO60830 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TIMM17BO60830 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TIMM17BO60830 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TIMM17BO60830 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TIMM17BO60830 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TIMM17BO60830 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TIMM17BO60830 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TIMM17BO60830 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TIMM17BO60830 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TIMM17BO60830 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TIMM17BO60830 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TIMM17BO60830 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TIMM17BO60830 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TIMM17BO60830 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TIMM17BO60830 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TIMM17BO60830 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TIMM17BO60830 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TIMM17BO60830 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TIMM17BO60830 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TIMM17BO60830 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TIMM17BO60830 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TIMM17BO60830 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TIMM17BO60830 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TIMM17BO60830 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TIMM17BO60830 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TIMM17BO60830 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TIMM17BO60830 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TIMM17BO60830 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TIMM17BO60830 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TIMM17BO60830 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TIMM17BO60830 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TIMM17BO60830 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TIMM17BO60830 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TIMM17BO60830 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TIMM17BO60830 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TIMM17BO60830 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TIMM17BO60830 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TIMM17BO60830 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TIMM17BO60830 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TIMM17BO60830 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TIMM17BO60830 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TIMM17BO60830 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TIMM17BO60830 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TIMM17BO60830 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TIMM17BO60830 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TIMM17BO60830 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TIMM17BO60830 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TIMM17BO60830 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TIMM17BO60830 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TIMM17BO60830 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TIMM17BO60830 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TIMM17BO60830 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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TIMM17BO60830 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TIMM17BO60830 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TIMM17BO60830 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TIMM17BO60830 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TIMM17BO60830 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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TIMM17BO60830 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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TIMM17BO60830 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TIMM17BO60830 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TIMM17BO60830 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TIMM17BO60830 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TIMM17BO60830 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TIMM17BO60830 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TIMM17BO60830 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TIMM17BO60830 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TIMM17BO60830 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TIMM17BO60830 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TIMM17BO60830 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TIMM17BO60830 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TIMM17BO60830 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TIMM17BO60830 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TIMM17BO60830 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TIMM17BO60830 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TIMM17BO60830 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TIMM17BO60830 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TIMM17BO60830 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TIMM17BO60830 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
TIMM17BO60830 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TIMM17BO60830 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TIMM17BO60830 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
TIMM17BO60830 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TIMM17BO60830 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TIMM17BO60830 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TIMM17BO60830 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
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