Protein–RNA interactions for Protein: E2RYF7

HCG22, Protein PBMUCL2, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG22E2RYF7 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HCG22E2RYF7 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms