Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHX1

PUF60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60Q9UHX1 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PUF60Q9UHX1 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PUF60Q9UHX1 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PUF60Q9UHX1 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PUF60Q9UHX1 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PUF60Q9UHX1 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PUF60Q9UHX1 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PUF60Q9UHX1 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PUF60Q9UHX1 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PUF60Q9UHX1 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PUF60Q9UHX1 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PUF60Q9UHX1 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PUF60Q9UHX1 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PUF60Q9UHX1 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PUF60Q9UHX1 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PUF60Q9UHX1 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PUF60Q9UHX1 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PUF60Q9UHX1 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PUF60Q9UHX1 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PUF60Q9UHX1 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PUF60Q9UHX1 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PUF60Q9UHX1 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PUF60Q9UHX1 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PUF60Q9UHX1 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PUF60Q9UHX1 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PUF60Q9UHX1 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PUF60Q9UHX1 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PUF60Q9UHX1 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PUF60Q9UHX1 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PUF60Q9UHX1 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PUF60Q9UHX1 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PUF60Q9UHX1 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PUF60Q9UHX1 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PUF60Q9UHX1 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PUF60Q9UHX1 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PUF60Q9UHX1 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PUF60Q9UHX1 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PUF60Q9UHX1 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PUF60Q9UHX1 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PUF60Q9UHX1 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PUF60Q9UHX1 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PUF60Q9UHX1 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PUF60Q9UHX1 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PUF60Q9UHX1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PUF60Q9UHX1 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PUF60Q9UHX1 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PUF60Q9UHX1 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PUF60Q9UHX1 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PUF60Q9UHX1 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PUF60Q9UHX1 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PUF60Q9UHX1 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PUF60Q9UHX1 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PUF60Q9UHX1 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PUF60Q9UHX1 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PUF60Q9UHX1 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PUF60Q9UHX1 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PUF60Q9UHX1 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PUF60Q9UHX1 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PUF60Q9UHX1 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PUF60Q9UHX1 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PUF60Q9UHX1 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PUF60Q9UHX1 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PUF60Q9UHX1 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PUF60Q9UHX1 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PUF60Q9UHX1 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PUF60Q9UHX1 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PUF60Q9UHX1 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PUF60Q9UHX1 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PUF60Q9UHX1 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PUF60Q9UHX1 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms