Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ63

C9orf78, Telomere length and silencing protein 1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf78Q9NZ63 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
C9orf78Q9NZ63 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
C9orf78Q9NZ63 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C9orf78Q9NZ63 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
C9orf78Q9NZ63 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
C9orf78Q9NZ63 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C9orf78Q9NZ63 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C9orf78Q9NZ63 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C9orf78Q9NZ63 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C9orf78Q9NZ63 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C9orf78Q9NZ63 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C9orf78Q9NZ63 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C9orf78Q9NZ63 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C9orf78Q9NZ63 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C9orf78Q9NZ63 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C9orf78Q9NZ63 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C9orf78Q9NZ63 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C9orf78Q9NZ63 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
C9orf78Q9NZ63 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C9orf78Q9NZ63 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
C9orf78Q9NZ63 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C9orf78Q9NZ63 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C9orf78Q9NZ63 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C9orf78Q9NZ63 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C9orf78Q9NZ63 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C9orf78Q9NZ63 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C9orf78Q9NZ63 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C9orf78Q9NZ63 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C9orf78Q9NZ63 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C9orf78Q9NZ63 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C9orf78Q9NZ63 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C9orf78Q9NZ63 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
C9orf78Q9NZ63 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C9orf78Q9NZ63 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C9orf78Q9NZ63 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C9orf78Q9NZ63 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C9orf78Q9NZ63 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C9orf78Q9NZ63 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
C9orf78Q9NZ63 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C9orf78Q9NZ63 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
C9orf78Q9NZ63 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C9orf78Q9NZ63 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C9orf78Q9NZ63 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C9orf78Q9NZ63 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C9orf78Q9NZ63 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C9orf78Q9NZ63 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C9orf78Q9NZ63 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C9orf78Q9NZ63 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C9orf78Q9NZ63 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C9orf78Q9NZ63 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C9orf78Q9NZ63 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C9orf78Q9NZ63 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C9orf78Q9NZ63 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C9orf78Q9NZ63 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C9orf78Q9NZ63 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C9orf78Q9NZ63 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C9orf78Q9NZ63 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C9orf78Q9NZ63 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C9orf78Q9NZ63 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
C9orf78Q9NZ63 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C9orf78Q9NZ63 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C9orf78Q9NZ63 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C9orf78Q9NZ63 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C9orf78Q9NZ63 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C9orf78Q9NZ63 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C9orf78Q9NZ63 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C9orf78Q9NZ63 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C9orf78Q9NZ63 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C9orf78Q9NZ63 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C9orf78Q9NZ63 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C9orf78Q9NZ63 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C9orf78Q9NZ63 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
C9orf78Q9NZ63 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
C9orf78Q9NZ63 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
C9orf78Q9NZ63 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
C9orf78Q9NZ63 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
C9orf78Q9NZ63 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
C9orf78Q9NZ63 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
C9orf78Q9NZ63 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
C9orf78Q9NZ63 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C9orf78Q9NZ63 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms