Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM5Q9C035 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM5Q9C035 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms