Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY65

NPCDR1, Nasopharyngeal carcinoma down-regulated gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPCDR1Q9BY65 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPCDR1Q9BY65 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPCDR1Q9BY65 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPCDR1Q9BY65 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPCDR1Q9BY65 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPCDR1Q9BY65 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPCDR1Q9BY65 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPCDR1Q9BY65 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPCDR1Q9BY65 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPCDR1Q9BY65 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPCDR1Q9BY65 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPCDR1Q9BY65 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPCDR1Q9BY65 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPCDR1Q9BY65 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NPCDR1Q9BY65 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPCDR1Q9BY65 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPCDR1Q9BY65 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPCDR1Q9BY65 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPCDR1Q9BY65 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPCDR1Q9BY65 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPCDR1Q9BY65 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPCDR1Q9BY65 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPCDR1Q9BY65 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPCDR1Q9BY65 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPCDR1Q9BY65 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPCDR1Q9BY65 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPCDR1Q9BY65 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NPCDR1Q9BY65 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPCDR1Q9BY65 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NPCDR1Q9BY65 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPCDR1Q9BY65 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPCDR1Q9BY65 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPCDR1Q9BY65 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPCDR1Q9BY65 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPCDR1Q9BY65 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPCDR1Q9BY65 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NPCDR1Q9BY65 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPCDR1Q9BY65 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPCDR1Q9BY65 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPCDR1Q9BY65 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPCDR1Q9BY65 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPCDR1Q9BY65 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPCDR1Q9BY65 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPCDR1Q9BY65 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPCDR1Q9BY65 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPCDR1Q9BY65 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPCDR1Q9BY65 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPCDR1Q9BY65 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPCDR1Q9BY65 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPCDR1Q9BY65 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPCDR1Q9BY65 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPCDR1Q9BY65 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPCDR1Q9BY65 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPCDR1Q9BY65 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPCDR1Q9BY65 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPCDR1Q9BY65 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPCDR1Q9BY65 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPCDR1Q9BY65 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPCDR1Q9BY65 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPCDR1Q9BY65 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPCDR1Q9BY65 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPCDR1Q9BY65 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPCDR1Q9BY65 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPCDR1Q9BY65 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPCDR1Q9BY65 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPCDR1Q9BY65 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPCDR1Q9BY65 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPCDR1Q9BY65 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPCDR1Q9BY65 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPCDR1Q9BY65 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPCDR1Q9BY65 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPCDR1Q9BY65 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPCDR1Q9BY65 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NPCDR1Q9BY65 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NPCDR1Q9BY65 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NPCDR1Q9BY65 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NPCDR1Q9BY65 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPCDR1Q9BY65 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPCDR1Q9BY65 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPCDR1Q9BY65 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPCDR1Q9BY65 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPCDR1Q9BY65 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NPCDR1Q9BY65 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
NPCDR1Q9BY65 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NPCDR1Q9BY65 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NPCDR1Q9BY65 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NPCDR1Q9BY65 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPCDR1Q9BY65 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPCDR1Q9BY65 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NPCDR1Q9BY65 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NPCDR1Q9BY65 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPCDR1Q9BY65 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPCDR1Q9BY65 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NPCDR1Q9BY65 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPCDR1Q9BY65 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPCDR1Q9BY65 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NPCDR1Q9BY65 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NPCDR1Q9BY65 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPCDR1Q9BY65 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NPCDR1Q9BY65 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms