Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms