Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms