Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RNF185Q96GF1 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms