Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Q1

TMCO5A, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5AQ8N6Q1 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMCO5AQ8N6Q1 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMCO5AQ8N6Q1 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMCO5AQ8N6Q1 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMCO5AQ8N6Q1 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMCO5AQ8N6Q1 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMCO5AQ8N6Q1 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
TMCO5AQ8N6Q1 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMCO5AQ8N6Q1 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMCO5AQ8N6Q1 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMCO5AQ8N6Q1 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMCO5AQ8N6Q1 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMCO5AQ8N6Q1 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMCO5AQ8N6Q1 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMCO5AQ8N6Q1 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMCO5AQ8N6Q1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMCO5AQ8N6Q1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMCO5AQ8N6Q1 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMCO5AQ8N6Q1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMCO5AQ8N6Q1 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMCO5AQ8N6Q1 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMCO5AQ8N6Q1 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMCO5AQ8N6Q1 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMCO5AQ8N6Q1 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMCO5AQ8N6Q1 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMCO5AQ8N6Q1 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMCO5AQ8N6Q1 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMCO5AQ8N6Q1 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMCO5AQ8N6Q1 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMCO5AQ8N6Q1 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMCO5AQ8N6Q1 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMCO5AQ8N6Q1 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMCO5AQ8N6Q1 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMCO5AQ8N6Q1 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMCO5AQ8N6Q1 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMCO5AQ8N6Q1 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TMCO5AQ8N6Q1 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMCO5AQ8N6Q1 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMCO5AQ8N6Q1 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMCO5AQ8N6Q1 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMCO5AQ8N6Q1 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMCO5AQ8N6Q1 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMCO5AQ8N6Q1 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMCO5AQ8N6Q1 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMCO5AQ8N6Q1 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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TMCO5AQ8N6Q1 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMCO5AQ8N6Q1 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMCO5AQ8N6Q1 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMCO5AQ8N6Q1 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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TMCO5AQ8N6Q1 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMCO5AQ8N6Q1 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMCO5AQ8N6Q1 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMCO5AQ8N6Q1 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMCO5AQ8N6Q1 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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TMCO5AQ8N6Q1 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMCO5AQ8N6Q1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMCO5AQ8N6Q1 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMCO5AQ8N6Q1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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TMCO5AQ8N6Q1 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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TMCO5AQ8N6Q1 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMCO5AQ8N6Q1 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMCO5AQ8N6Q1 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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TMCO5AQ8N6Q1 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMCO5AQ8N6Q1 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMCO5AQ8N6Q1 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TMCO5AQ8N6Q1 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMCO5AQ8N6Q1 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMCO5AQ8N6Q1 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMCO5AQ8N6Q1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMCO5AQ8N6Q1 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMCO5AQ8N6Q1 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMCO5AQ8N6Q1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMCO5AQ8N6Q1 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMCO5AQ8N6Q1 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMCO5AQ8N6Q1 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TMCO5AQ8N6Q1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMCO5AQ8N6Q1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMCO5AQ8N6Q1 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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