Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMIM5Q71RC9 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms