Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB30

CSAG1, Putative chondrosarcoma-associated gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1Q6PB30 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC9.8□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC9.79□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
CSAG1Q6PB30 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms