Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCTP1Q6DN14 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCTP1Q6DN14 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCTP1Q6DN14 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCTP1Q6DN14 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCTP1Q6DN14 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCTP1Q6DN14 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCTP1Q6DN14 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCTP1Q6DN14 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCTP1Q6DN14 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCTP1Q6DN14 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCTP1Q6DN14 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCTP1Q6DN14 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCTP1Q6DN14 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCTP1Q6DN14 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCTP1Q6DN14 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCTP1Q6DN14 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCTP1Q6DN14 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MCTP1Q6DN14 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCTP1Q6DN14 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCTP1Q6DN14 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCTP1Q6DN14 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCTP1Q6DN14 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCTP1Q6DN14 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCTP1Q6DN14 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCTP1Q6DN14 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCTP1Q6DN14 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCTP1Q6DN14 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms