Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PUM1Q14671 RPL13-209ENST00000491523 698 ntTSL 323.04■■□□□ 1.288e-21■□□□□ 9.8
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PUM1Q14671 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.642e-11■□□□□ 9.8
PUM1Q14671 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.682e-11■□□□□ 9.8
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PUM1Q14671 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.327e-8■□□□□ 9.8
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PUM1Q14671 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.097e-8■□□□□ 9.8
PUM1Q14671 R3HDM4-204ENST00000589428 1704 ntTSL 320.94■□□□□ 0.947e-8■□□□□ 9.8
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PUM1Q14671 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.049e-9■□□□□ 9.7
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PUM1Q14671 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.631e-6■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.221e-6■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 NPM1-206ENST00000519955 571 ntTSL 26.53□□□□□ -1.364e-46■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.564e-46■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 HIST1H2BG-201ENST00000541790 1534 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.653e-22■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.28e-10■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.238e-10■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 VAPA-207ENST00000583879 719 ntTSL 25.98□□□□□ -1.458e-10■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 VAPA-208ENST00000584796 654 ntTSL 34.87□□□□□ -1.638e-10■□□□□ 9.7
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PUM1Q14671 IPO5-222ENST00000490680 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.271e-6■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 IPO5-223ENST00000491555 3688 ntTSL 25.02□□□□□ -1.611e-6■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.641e-6■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 YBX3-214ENST00000544501 181 ntTSL 22.96□□□□□ -1.948e-7■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.221e-6■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.992e-7■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 POLR3GL-203ENST00000471706 755 ntTSL 521.22■□□□□ 0.992e-7■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.432e-7■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 POLR3GL-204ENST00000622508 1600 ntTSL 1 (best)14.54□□□□□ -0.082e-7■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 CBX3-204ENST00000456948 1068 ntTSL 523.76■■□□□ 1.398e-23■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 DCUN1D4-220ENST00000511675 643 ntTSL 226.2■■□□□ 1.784e-7■□□□□ 9.7
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