Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
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