Protein–RNA interactions for Protein: O43805

SSNA1, Sjoegren syndrome nuclear autoantigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSNA1O43805 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms