Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBXN8O00124 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBXN8O00124 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBXN8O00124 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBXN8O00124 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBXN8O00124 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBXN8O00124 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBXN8O00124 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBXN8O00124 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBXN8O00124 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBXN8O00124 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBXN8O00124 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBXN8O00124 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBXN8O00124 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBXN8O00124 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBXN8O00124 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBXN8O00124 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBXN8O00124 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBXN8O00124 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBXN8O00124 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
UBXN8O00124 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBXN8O00124 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
UBXN8O00124 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
UBXN8O00124 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBXN8O00124 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBXN8O00124 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBXN8O00124 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms