Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms