Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 NOTCH2-206ENST00000579475 2954 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL378P-201ENST00000582657 298 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 AC004840.2-201ENST00000603368 285 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 RAPGEF5-212ENST00000620335 5506 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 Metazoa_SRP.54-201ENST00000620533 282 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 AL359741.1-201ENST00000621262 225 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC35A4-204ENST00000623481 683 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 AC007326.3-201ENST00000636418 176 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR4317-201ENST00000637586 65 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 IPO7-201ENST00000379719 6191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 SCARB2-211ENST00000638603 4284 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 PKP4-AS1-201ENST00000342892 4067 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 TRPC4-206ENST00000379705 4059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 CHTF8-201ENST00000306585 2561 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ARAP1-207ENST00000429686 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 PALLD-201ENST00000261509 5809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 BTN3A2-201ENST00000356386 3017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ZIC4-201ENST00000383075 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 SORBS1-210ENST00000371246 6931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC11A2-202ENST00000262052 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ZSCAN26-202ENST00000421553 2835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 MTMR8-201ENST00000374852 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01630-208ENST00000635680 4363 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 KIAA1671-202ENST00000401395 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 GIGYF2-202ENST00000409196 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ATAD1-201ENST00000308448 4640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00683-202ENST00000579781 3510 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ZWILCH-201ENST00000307897 3960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF264-201ENST00000263095 12163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC38A2-201ENST00000256689 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 CCDC18-201ENST00000343253 4867 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 SH3GLB1-203ENST00000535010 6227 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00969-212ENST00000445430 4208 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 EIF5A2-201ENST00000295822 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 CUL4B-201ENST00000336592 3109 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 FBXO22-201ENST00000308275 10725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 BROX-209ENST00000612948 4028 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 C1QTNF7-204ENST00000429690 4464 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 VWA3B-213ENST00000477737 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 MTMR4-201ENST00000323456 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 HAPLN1-201ENST00000274341 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF41-201ENST00000313116 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 DENND5B-203ENST00000536562 4291 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 EPHA4-201ENST00000281821 6346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 FBN2-208ENST00000619499 10154 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ERG-205ENST00000398910 4954 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF549-202ENST00000376233 4053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 SBNO1-203ENST00000602398 4313 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 LDB3-201ENST00000263066 3873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 NSUN4-208ENST00000498008 3867 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 HS6ST3-202ENST00000620595 7073 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 KIAA0586-201ENST00000261244 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 PRKG1-204ENST00000373985 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 PC-203ENST00000393960 4192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 DNAH9-203ENST00000454412 13452 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 MAP3K13-209ENST00000443863 3025 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 PDE8A-208ENST00000557957 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 NCAM1-201ENST00000316851 5837 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 KIF18B-202ENST00000587309 4217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 DDX31-205ENST00000438527 2814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 PC-201ENST00000393955 4004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 CSF3R-201ENST00000331941 2375 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 BRPF3-211ENST00000534400 4254 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP5G3-201ENST00000284727 5484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 HLF-210ENST00000575345 3589 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 FAT3-206ENST00000533797 7894 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC38A7-206ENST00000564100 2867 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 CMSS1-201ENST00000421999 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 KIF9-202ENST00000335044 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ABCA8-208ENST00000586539 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 SPATA31C1-201ENST00000420021 3895 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 PROX2-202ENST00000556489 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 CBFA2T2-209ENST00000492345 7803 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 GALNTL6-203ENST00000506823 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 GFRA1-203ENST00000369236 9109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 TMCO4-201ENST00000294543 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 MROH7-204ENST00000409996 2977 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 FCHO1-218ENST00000596951 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC13A3-202ENST00000290317 3994 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 HERC2P4-205ENST00000566902 3957 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 MCM8-205ENST00000610722 7486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ITK-201ENST00000422843 4528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 GADL1-202ENST00000454381 4509 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 FRMD4B-210ENST00000478263 3761 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms