Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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SNX13Q9Y5W8 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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SNX13Q9Y5W8 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
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SNX13Q9Y5W8 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
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SNX13Q9Y5W8 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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SNX13Q9Y5W8 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
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SNX13Q9Y5W8 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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SNX13Q9Y5W8 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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SNX13Q9Y5W8 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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SNX13Q9Y5W8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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SNX13Q9Y5W8 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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SNX13Q9Y5W8 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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SNX13Q9Y5W8 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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SNX13Q9Y5W8 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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SNX13Q9Y5W8 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX13Q9Y5W8 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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