Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRZ9

HELLS, Lymphoid-specific helicase, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELLSQ9NRZ9 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HELLSQ9NRZ9 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms