Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K3

ACTR3C, Actin-related protein 3C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3CQ9C0K3 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTR3CQ9C0K3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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