Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2AFJQ9BTM1 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms