Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXN2

TREML4, Trem-like transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML4Q6UXN2 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREML4Q6UXN2 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms