Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms