Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KHDC3LQ587J8 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KHDC3LQ587J8 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms