Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CTXN3Q4LDR2 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTXN3Q4LDR2 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTXN3Q4LDR2 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTXN3Q4LDR2 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTXN3Q4LDR2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTXN3Q4LDR2 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTXN3Q4LDR2 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTXN3Q4LDR2 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTXN3Q4LDR2 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTXN3Q4LDR2 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTXN3Q4LDR2 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTXN3Q4LDR2 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTXN3Q4LDR2 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTXN3Q4LDR2 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTXN3Q4LDR2 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTXN3Q4LDR2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTXN3Q4LDR2 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTXN3Q4LDR2 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTXN3Q4LDR2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTXN3Q4LDR2 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTXN3Q4LDR2 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTXN3Q4LDR2 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTXN3Q4LDR2 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTXN3Q4LDR2 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTXN3Q4LDR2 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CTXN3Q4LDR2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTXN3Q4LDR2 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTXN3Q4LDR2 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTXN3Q4LDR2 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTXN3Q4LDR2 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTXN3Q4LDR2 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTXN3Q4LDR2 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTXN3Q4LDR2 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTXN3Q4LDR2 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTXN3Q4LDR2 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTXN3Q4LDR2 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTXN3Q4LDR2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTXN3Q4LDR2 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTXN3Q4LDR2 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTXN3Q4LDR2 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTXN3Q4LDR2 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTXN3Q4LDR2 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTXN3Q4LDR2 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTXN3Q4LDR2 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CTXN3Q4LDR2 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTXN3Q4LDR2 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CTXN3Q4LDR2 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTXN3Q4LDR2 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTXN3Q4LDR2 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTXN3Q4LDR2 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CTXN3Q4LDR2 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTXN3Q4LDR2 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTXN3Q4LDR2 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTXN3Q4LDR2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTXN3Q4LDR2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTXN3Q4LDR2 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTXN3Q4LDR2 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTXN3Q4LDR2 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTXN3Q4LDR2 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTXN3Q4LDR2 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTXN3Q4LDR2 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTXN3Q4LDR2 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTXN3Q4LDR2 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
CTXN3Q4LDR2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
CTXN3Q4LDR2 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
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