Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
KLHL40Q2TBA0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL40Q2TBA0 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms