Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q1T7F1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q1T7F1 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q1T7F1 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q1T7F1 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q1T7F1 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q1T7F1 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q1T7F1 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q1T7F1 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Q1T7F1 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q1T7F1 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q1T7F1 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q1T7F1 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q1T7F1 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q1T7F1 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q1T7F1 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q1T7F1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q1T7F1 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q1T7F1 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q1T7F1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q1T7F1 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q1T7F1 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q1T7F1 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q1T7F1 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q1T7F1 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q1T7F1 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q1T7F1 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q1T7F1 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q1T7F1 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q1T7F1 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q1T7F1 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q1T7F1 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q1T7F1 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q1T7F1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q1T7F1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q1T7F1 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q1T7F1 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q1T7F1 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q1T7F1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q1T7F1 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q1T7F1 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q1T7F1 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q1T7F1 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q1T7F1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q1T7F1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q1T7F1 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q1T7F1 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q1T7F1 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q1T7F1 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q1T7F1 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q1T7F1 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q1T7F1 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q1T7F1 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q1T7F1 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q1T7F1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q1T7F1 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q1T7F1 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q1T7F1 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q1T7F1 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Q1T7F1 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Q1T7F1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Q1T7F1 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Q1T7F1 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Q1T7F1 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Q1T7F1 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Q1T7F1 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Q1T7F1 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Q1T7F1 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Q1T7F1 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q1T7F1 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q1T7F1 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q1T7F1 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q1T7F1 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q1T7F1 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q1T7F1 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Q1T7F1 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q1T7F1 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q1T7F1 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q1T7F1 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q1T7F1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q1T7F1 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Q1T7F1 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q1T7F1 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q1T7F1 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q1T7F1 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q1T7F1 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q1T7F1 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q1T7F1 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q1T7F1 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q1T7F1 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q1T7F1 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q1T7F1 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q1T7F1 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q1T7F1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q1T7F1 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q1T7F1 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q1T7F1 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q1T7F1 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q1T7F1 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q1T7F1 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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