Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
IFFO1Q0D2I5 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms