Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
H2BFSP57053 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms