Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOSBP53539 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOSBP53539 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOSBP53539 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOSBP53539 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOSBP53539 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOSBP53539 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOSBP53539 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOSBP53539 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOSBP53539 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOSBP53539 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FOSBP53539 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOSBP53539 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOSBP53539 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOSBP53539 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOSBP53539 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOSBP53539 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOSBP53539 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOSBP53539 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOSBP53539 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOSBP53539 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOSBP53539 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOSBP53539 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOSBP53539 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOSBP53539 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOSBP53539 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOSBP53539 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOSBP53539 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOSBP53539 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOSBP53539 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOSBP53539 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOSBP53539 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOSBP53539 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOSBP53539 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOSBP53539 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FOSBP53539 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOSBP53539 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOSBP53539 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOSBP53539 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FOSBP53539 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOSBP53539 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOSBP53539 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOSBP53539 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FOSBP53539 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOSBP53539 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOSBP53539 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOSBP53539 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOSBP53539 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOSBP53539 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOSBP53539 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOSBP53539 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOSBP53539 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOSBP53539 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOSBP53539 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOSBP53539 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOSBP53539 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOSBP53539 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOSBP53539 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOSBP53539 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOSBP53539 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOSBP53539 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOSBP53539 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOSBP53539 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOSBP53539 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOSBP53539 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FOSBP53539 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOSBP53539 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOSBP53539 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOSBP53539 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOSBP53539 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOSBP53539 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOSBP53539 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOSBP53539 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOSBP53539 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOSBP53539 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOSBP53539 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOSBP53539 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOSBP53539 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOSBP53539 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOSBP53539 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOSBP53539 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOSBP53539 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOSBP53539 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOSBP53539 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOSBP53539 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOSBP53539 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOSBP53539 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOSBP53539 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FOSBP53539 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOSBP53539 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOSBP53539 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOSBP53539 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOSBP53539 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOSBP53539 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOSBP53539 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOSBP53539 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOSBP53539 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FOSBP53539 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOSBP53539 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOSBP53539 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms