Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms