Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACTN2P35609 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACTN2P35609 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACTN2P35609 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACTN2P35609 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACTN2P35609 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACTN2P35609 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACTN2P35609 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
ACTN2P35609 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTN2P35609 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTN2P35609 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTN2P35609 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTN2P35609 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTN2P35609 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTN2P35609 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTN2P35609 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTN2P35609 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTN2P35609 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTN2P35609 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTN2P35609 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTN2P35609 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTN2P35609 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTN2P35609 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTN2P35609 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTN2P35609 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTN2P35609 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTN2P35609 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTN2P35609 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTN2P35609 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTN2P35609 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTN2P35609 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTN2P35609 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTN2P35609 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTN2P35609 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTN2P35609 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTN2P35609 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTN2P35609 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTN2P35609 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTN2P35609 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTN2P35609 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTN2P35609 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTN2P35609 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTN2P35609 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTN2P35609 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTN2P35609 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTN2P35609 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTN2P35609 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTN2P35609 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTN2P35609 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTN2P35609 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTN2P35609 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTN2P35609 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTN2P35609 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTN2P35609 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTN2P35609 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTN2P35609 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTN2P35609 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms