Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP1P29466 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP1P29466 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP1P29466 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP1P29466 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP1P29466 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP1P29466 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP1P29466 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP1P29466 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP1P29466 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP1P29466 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP1P29466 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP1P29466 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP1P29466 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP1P29466 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP1P29466 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP1P29466 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP1P29466 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP1P29466 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP1P29466 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP1P29466 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP1P29466 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP1P29466 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP1P29466 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP1P29466 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP1P29466 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP1P29466 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP1P29466 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP1P29466 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP1P29466 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP1P29466 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP1P29466 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP1P29466 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP1P29466 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP1P29466 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP1P29466 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP1P29466 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP1P29466 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP1P29466 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP1P29466 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP1P29466 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP1P29466 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP1P29466 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP1P29466 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP1P29466 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP1P29466 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP1P29466 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP1P29466 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP1P29466 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP1P29466 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP1P29466 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP1P29466 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP1P29466 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP1P29466 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP1P29466 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP1P29466 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP1P29466 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP1P29466 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP1P29466 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP1P29466 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP1P29466 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP1P29466 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP1P29466 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP1P29466 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP1P29466 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP1P29466 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP1P29466 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP1P29466 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP1P29466 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP1P29466 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP1P29466 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP1P29466 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP1P29466 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP1P29466 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP1P29466 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP1P29466 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP1P29466 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP1P29466 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP1P29466 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP1P29466 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP1P29466 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP1P29466 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP1P29466 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP1P29466 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP1P29466 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP1P29466 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP1P29466 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP1P29466 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP1P29466 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP1P29466 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP1P29466 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP1P29466 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP1P29466 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP1P29466 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP1P29466 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP1P29466 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP1P29466 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP1P29466 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP1P29466 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP1P29466 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms