Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP2B1P20020 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms