Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAK2O60296 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms