Protein–RNA interactions for Protein: O60232

SSSCA1, Sjoegren syndrome/scleroderma autoantigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSSCA1O60232 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSSCA1O60232 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSSCA1O60232 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSSCA1O60232 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSSCA1O60232 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSSCA1O60232 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSSCA1O60232 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSSCA1O60232 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSSCA1O60232 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSSCA1O60232 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSSCA1O60232 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSSCA1O60232 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSSCA1O60232 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSSCA1O60232 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSSCA1O60232 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSSCA1O60232 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSSCA1O60232 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSSCA1O60232 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSSCA1O60232 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSSCA1O60232 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSSCA1O60232 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSSCA1O60232 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSSCA1O60232 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSSCA1O60232 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSSCA1O60232 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSSCA1O60232 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSSCA1O60232 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SSSCA1O60232 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSSCA1O60232 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSSCA1O60232 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSSCA1O60232 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSSCA1O60232 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSSCA1O60232 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSSCA1O60232 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSSCA1O60232 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSSCA1O60232 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSSCA1O60232 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSSCA1O60232 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSSCA1O60232 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSSCA1O60232 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSSCA1O60232 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSSCA1O60232 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSSCA1O60232 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSSCA1O60232 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSSCA1O60232 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSSCA1O60232 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSSCA1O60232 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSSCA1O60232 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSSCA1O60232 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSSCA1O60232 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSSCA1O60232 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSSCA1O60232 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSSCA1O60232 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSSCA1O60232 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSSCA1O60232 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSSCA1O60232 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSSCA1O60232 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSSCA1O60232 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSSCA1O60232 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SSSCA1O60232 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SSSCA1O60232 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSSCA1O60232 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSSCA1O60232 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSSCA1O60232 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSSCA1O60232 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSSCA1O60232 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSSCA1O60232 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSSCA1O60232 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSSCA1O60232 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSSCA1O60232 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSSCA1O60232 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSSCA1O60232 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSSCA1O60232 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSSCA1O60232 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSSCA1O60232 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSSCA1O60232 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSSCA1O60232 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSSCA1O60232 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSSCA1O60232 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSSCA1O60232 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSSCA1O60232 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSSCA1O60232 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSSCA1O60232 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSSCA1O60232 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSSCA1O60232 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSSCA1O60232 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSSCA1O60232 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSSCA1O60232 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSSCA1O60232 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSSCA1O60232 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SSSCA1O60232 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SSSCA1O60232 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSSCA1O60232 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSSCA1O60232 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSSCA1O60232 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSSCA1O60232 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSSCA1O60232 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSSCA1O60232 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSSCA1O60232 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSSCA1O60232 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms