Protein–RNA interactions for Protein: O43819

SCO2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCO2O43819 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCO2O43819 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCO2O43819 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCO2O43819 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCO2O43819 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCO2O43819 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCO2O43819 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCO2O43819 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCO2O43819 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCO2O43819 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCO2O43819 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCO2O43819 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCO2O43819 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCO2O43819 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCO2O43819 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCO2O43819 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCO2O43819 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCO2O43819 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCO2O43819 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCO2O43819 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCO2O43819 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCO2O43819 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCO2O43819 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCO2O43819 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCO2O43819 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCO2O43819 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCO2O43819 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCO2O43819 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCO2O43819 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCO2O43819 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCO2O43819 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCO2O43819 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCO2O43819 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCO2O43819 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCO2O43819 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCO2O43819 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCO2O43819 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCO2O43819 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCO2O43819 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCO2O43819 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCO2O43819 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCO2O43819 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCO2O43819 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCO2O43819 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCO2O43819 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SCO2O43819 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCO2O43819 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCO2O43819 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCO2O43819 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCO2O43819 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCO2O43819 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCO2O43819 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCO2O43819 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCO2O43819 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCO2O43819 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCO2O43819 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCO2O43819 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCO2O43819 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCO2O43819 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCO2O43819 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCO2O43819 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCO2O43819 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCO2O43819 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCO2O43819 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCO2O43819 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCO2O43819 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCO2O43819 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCO2O43819 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCO2O43819 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCO2O43819 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCO2O43819 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCO2O43819 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCO2O43819 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCO2O43819 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCO2O43819 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCO2O43819 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCO2O43819 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCO2O43819 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SCO2O43819 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCO2O43819 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCO2O43819 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCO2O43819 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCO2O43819 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCO2O43819 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCO2O43819 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCO2O43819 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCO2O43819 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCO2O43819 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCO2O43819 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCO2O43819 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCO2O43819 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCO2O43819 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCO2O43819 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCO2O43819 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCO2O43819 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCO2O43819 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCO2O43819 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCO2O43819 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCO2O43819 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCO2O43819 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms