Protein–RNA interactions for Protein: B4E171

Tetraspanin, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E171 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
B4E171 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4E171 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4E171 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4E171 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4E171 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4E171 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4E171 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4E171 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4E171 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
B4E171 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4E171 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4E171 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4E171 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4E171 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4E171 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4E171 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4E171 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4E171 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4E171 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4E171 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4E171 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4E171 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4E171 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
B4E171 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4E171 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4E171 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4E171 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4E171 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4E171 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4E171 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
B4E171 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4E171 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4E171 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4E171 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4E171 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4E171 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4E171 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4E171 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4E171 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4E171 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
B4E171 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4E171 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4E171 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
B4E171 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
B4E171 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
B4E171 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
B4E171 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
B4E171 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
B4E171 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
B4E171 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
B4E171 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
B4E171 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
B4E171 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
B4E171 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
B4E171 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
B4E171 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
B4E171 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
B4E171 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
B4E171 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
B4E171 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
B4E171 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
B4E171 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
B4E171 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
B4E171 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
B4E171 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
B4E171 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
B4E171 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
B4E171 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
B4E171 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
B4E171 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
B4E171 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
B4E171 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
B4E171 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
B4E171 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4E171 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4E171 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4E171 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4E171 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4E171 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4E171 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4E171 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4E171 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4E171 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4E171 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4E171 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4E171 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4E171 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4E171 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4E171 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4E171 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4E171 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4E171 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
B4E171 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4E171 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4E171 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4E171 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4E171 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4E171 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4E171 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms