Protein–RNA interactions for Protein: A6NIL9

CRYM-AS1, Putative uncharacterized protein CRYM-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRYM-AS1A6NIL9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRYM-AS1A6NIL9 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRYM-AS1A6NIL9 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRYM-AS1A6NIL9 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRYM-AS1A6NIL9 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRYM-AS1A6NIL9 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRYM-AS1A6NIL9 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRYM-AS1A6NIL9 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRYM-AS1A6NIL9 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRYM-AS1A6NIL9 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRYM-AS1A6NIL9 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRYM-AS1A6NIL9 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRYM-AS1A6NIL9 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRYM-AS1A6NIL9 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CRYM-AS1A6NIL9 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRYM-AS1A6NIL9 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRYM-AS1A6NIL9 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRYM-AS1A6NIL9 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRYM-AS1A6NIL9 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRYM-AS1A6NIL9 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRYM-AS1A6NIL9 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRYM-AS1A6NIL9 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRYM-AS1A6NIL9 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRYM-AS1A6NIL9 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRYM-AS1A6NIL9 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRYM-AS1A6NIL9 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRYM-AS1A6NIL9 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRYM-AS1A6NIL9 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRYM-AS1A6NIL9 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRYM-AS1A6NIL9 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRYM-AS1A6NIL9 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRYM-AS1A6NIL9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CRYM-AS1A6NIL9 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRYM-AS1A6NIL9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRYM-AS1A6NIL9 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRYM-AS1A6NIL9 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRYM-AS1A6NIL9 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRYM-AS1A6NIL9 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRYM-AS1A6NIL9 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRYM-AS1A6NIL9 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRYM-AS1A6NIL9 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRYM-AS1A6NIL9 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRYM-AS1A6NIL9 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRYM-AS1A6NIL9 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRYM-AS1A6NIL9 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRYM-AS1A6NIL9 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRYM-AS1A6NIL9 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRYM-AS1A6NIL9 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRYM-AS1A6NIL9 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRYM-AS1A6NIL9 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRYM-AS1A6NIL9 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRYM-AS1A6NIL9 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRYM-AS1A6NIL9 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRYM-AS1A6NIL9 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRYM-AS1A6NIL9 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRYM-AS1A6NIL9 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRYM-AS1A6NIL9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRYM-AS1A6NIL9 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRYM-AS1A6NIL9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRYM-AS1A6NIL9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRYM-AS1A6NIL9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRYM-AS1A6NIL9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRYM-AS1A6NIL9 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRYM-AS1A6NIL9 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRYM-AS1A6NIL9 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRYM-AS1A6NIL9 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRYM-AS1A6NIL9 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRYM-AS1A6NIL9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRYM-AS1A6NIL9 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRYM-AS1A6NIL9 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRYM-AS1A6NIL9 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRYM-AS1A6NIL9 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRYM-AS1A6NIL9 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRYM-AS1A6NIL9 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRYM-AS1A6NIL9 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRYM-AS1A6NIL9 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CRYM-AS1A6NIL9 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CRYM-AS1A6NIL9 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CRYM-AS1A6NIL9 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRYM-AS1A6NIL9 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRYM-AS1A6NIL9 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRYM-AS1A6NIL9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRYM-AS1A6NIL9 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRYM-AS1A6NIL9 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CRYM-AS1A6NIL9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRYM-AS1A6NIL9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRYM-AS1A6NIL9 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRYM-AS1A6NIL9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRYM-AS1A6NIL9 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CRYM-AS1A6NIL9 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CRYM-AS1A6NIL9 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRYM-AS1A6NIL9 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRYM-AS1A6NIL9 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRYM-AS1A6NIL9 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRYM-AS1A6NIL9 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRYM-AS1A6NIL9 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRYM-AS1A6NIL9 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRYM-AS1A6NIL9 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRYM-AS1A6NIL9 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRYM-AS1A6NIL9 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms