Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N9

USH1C, Harmonin, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USH1CQ9Y6N9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USH1CQ9Y6N9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USH1CQ9Y6N9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USH1CQ9Y6N9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USH1CQ9Y6N9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USH1CQ9Y6N9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USH1CQ9Y6N9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USH1CQ9Y6N9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USH1CQ9Y6N9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USH1CQ9Y6N9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USH1CQ9Y6N9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USH1CQ9Y6N9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USH1CQ9Y6N9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USH1CQ9Y6N9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USH1CQ9Y6N9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USH1CQ9Y6N9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USH1CQ9Y6N9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USH1CQ9Y6N9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USH1CQ9Y6N9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USH1CQ9Y6N9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USH1CQ9Y6N9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USH1CQ9Y6N9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USH1CQ9Y6N9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USH1CQ9Y6N9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USH1CQ9Y6N9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USH1CQ9Y6N9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USH1CQ9Y6N9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USH1CQ9Y6N9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USH1CQ9Y6N9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USH1CQ9Y6N9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USH1CQ9Y6N9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USH1CQ9Y6N9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USH1CQ9Y6N9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
USH1CQ9Y6N9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USH1CQ9Y6N9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USH1CQ9Y6N9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USH1CQ9Y6N9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USH1CQ9Y6N9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USH1CQ9Y6N9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USH1CQ9Y6N9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USH1CQ9Y6N9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USH1CQ9Y6N9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USH1CQ9Y6N9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USH1CQ9Y6N9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USH1CQ9Y6N9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
USH1CQ9Y6N9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USH1CQ9Y6N9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USH1CQ9Y6N9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USH1CQ9Y6N9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USH1CQ9Y6N9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USH1CQ9Y6N9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USH1CQ9Y6N9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USH1CQ9Y6N9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USH1CQ9Y6N9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25■■□□□ 1.59
USH1CQ9Y6N9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USH1CQ9Y6N9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USH1CQ9Y6N9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USH1CQ9Y6N9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USH1CQ9Y6N9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USH1CQ9Y6N9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USH1CQ9Y6N9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USH1CQ9Y6N9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USH1CQ9Y6N9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USH1CQ9Y6N9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
USH1CQ9Y6N9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USH1CQ9Y6N9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USH1CQ9Y6N9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USH1CQ9Y6N9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USH1CQ9Y6N9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USH1CQ9Y6N9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USH1CQ9Y6N9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USH1CQ9Y6N9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USH1CQ9Y6N9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USH1CQ9Y6N9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USH1CQ9Y6N9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USH1CQ9Y6N9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USH1CQ9Y6N9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USH1CQ9Y6N9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USH1CQ9Y6N9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USH1CQ9Y6N9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USH1CQ9Y6N9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USH1CQ9Y6N9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USH1CQ9Y6N9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USH1CQ9Y6N9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USH1CQ9Y6N9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USH1CQ9Y6N9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USH1CQ9Y6N9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USH1CQ9Y6N9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USH1CQ9Y6N9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USH1CQ9Y6N9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USH1CQ9Y6N9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USH1CQ9Y6N9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USH1CQ9Y6N9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USH1CQ9Y6N9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USH1CQ9Y6N9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USH1CQ9Y6N9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
USH1CQ9Y6N9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USH1CQ9Y6N9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USH1CQ9Y6N9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USH1CQ9Y6N9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152.1 ms