Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y678

COPG1, Coatomer subunit gamma-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG1Q9Y678 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
COPG1Q9Y678 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COPG1Q9Y678 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COPG1Q9Y678 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COPG1Q9Y678 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COPG1Q9Y678 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COPG1Q9Y678 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COPG1Q9Y678 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COPG1Q9Y678 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COPG1Q9Y678 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COPG1Q9Y678 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COPG1Q9Y678 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COPG1Q9Y678 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COPG1Q9Y678 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COPG1Q9Y678 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COPG1Q9Y678 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COPG1Q9Y678 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COPG1Q9Y678 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COPG1Q9Y678 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COPG1Q9Y678 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COPG1Q9Y678 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COPG1Q9Y678 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COPG1Q9Y678 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COPG1Q9Y678 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COPG1Q9Y678 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COPG1Q9Y678 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COPG1Q9Y678 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COPG1Q9Y678 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COPG1Q9Y678 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COPG1Q9Y678 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
COPG1Q9Y678 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COPG1Q9Y678 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COPG1Q9Y678 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COPG1Q9Y678 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COPG1Q9Y678 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COPG1Q9Y678 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COPG1Q9Y678 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COPG1Q9Y678 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COPG1Q9Y678 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COPG1Q9Y678 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COPG1Q9Y678 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COPG1Q9Y678 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COPG1Q9Y678 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COPG1Q9Y678 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COPG1Q9Y678 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COPG1Q9Y678 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COPG1Q9Y678 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
COPG1Q9Y678 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COPG1Q9Y678 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COPG1Q9Y678 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COPG1Q9Y678 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COPG1Q9Y678 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COPG1Q9Y678 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COPG1Q9Y678 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COPG1Q9Y678 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COPG1Q9Y678 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
COPG1Q9Y678 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COPG1Q9Y678 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COPG1Q9Y678 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COPG1Q9Y678 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COPG1Q9Y678 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COPG1Q9Y678 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COPG1Q9Y678 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COPG1Q9Y678 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COPG1Q9Y678 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COPG1Q9Y678 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COPG1Q9Y678 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COPG1Q9Y678 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COPG1Q9Y678 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COPG1Q9Y678 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COPG1Q9Y678 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COPG1Q9Y678 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COPG1Q9Y678 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COPG1Q9Y678 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COPG1Q9Y678 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COPG1Q9Y678 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COPG1Q9Y678 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COPG1Q9Y678 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COPG1Q9Y678 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COPG1Q9Y678 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COPG1Q9Y678 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COPG1Q9Y678 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COPG1Q9Y678 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COPG1Q9Y678 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COPG1Q9Y678 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COPG1Q9Y678 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COPG1Q9Y678 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COPG1Q9Y678 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COPG1Q9Y678 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COPG1Q9Y678 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COPG1Q9Y678 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COPG1Q9Y678 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COPG1Q9Y678 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COPG1Q9Y678 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COPG1Q9Y678 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COPG1Q9Y678 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COPG1Q9Y678 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COPG1Q9Y678 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
COPG1Q9Y678 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COPG1Q9Y678 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms