Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP15Q9Y4E8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP15Q9Y4E8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP15Q9Y4E8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP15Q9Y4E8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP15Q9Y4E8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP15Q9Y4E8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
USP15Q9Y4E8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP15Q9Y4E8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP15Q9Y4E8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP15Q9Y4E8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP15Q9Y4E8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP15Q9Y4E8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP15Q9Y4E8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP15Q9Y4E8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP15Q9Y4E8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP15Q9Y4E8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP15Q9Y4E8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP15Q9Y4E8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP15Q9Y4E8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP15Q9Y4E8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP15Q9Y4E8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP15Q9Y4E8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP15Q9Y4E8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
USP15Q9Y4E8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP15Q9Y4E8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP15Q9Y4E8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP15Q9Y4E8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP15Q9Y4E8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP15Q9Y4E8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
USP15Q9Y4E8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP15Q9Y4E8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP15Q9Y4E8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP15Q9Y4E8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP15Q9Y4E8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP15Q9Y4E8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP15Q9Y4E8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP15Q9Y4E8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP15Q9Y4E8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP15Q9Y4E8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP15Q9Y4E8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP15Q9Y4E8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP15Q9Y4E8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP15Q9Y4E8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP15Q9Y4E8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP15Q9Y4E8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP15Q9Y4E8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
USP15Q9Y4E8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
USP15Q9Y4E8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
USP15Q9Y4E8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP15Q9Y4E8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP15Q9Y4E8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP15Q9Y4E8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP15Q9Y4E8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP15Q9Y4E8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP15Q9Y4E8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
USP15Q9Y4E8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP15Q9Y4E8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP15Q9Y4E8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP15Q9Y4E8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP15Q9Y4E8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP15Q9Y4E8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP15Q9Y4E8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
USP15Q9Y4E8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP15Q9Y4E8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP15Q9Y4E8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP15Q9Y4E8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP15Q9Y4E8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP15Q9Y4E8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP15Q9Y4E8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP15Q9Y4E8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP15Q9Y4E8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP15Q9Y4E8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP15Q9Y4E8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP15Q9Y4E8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
USP15Q9Y4E8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
USP15Q9Y4E8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP15Q9Y4E8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP15Q9Y4E8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP15Q9Y4E8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP15Q9Y4E8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
USP15Q9Y4E8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP15Q9Y4E8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP15Q9Y4E8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP15Q9Y4E8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP15Q9Y4E8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP15Q9Y4E8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP15Q9Y4E8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP15Q9Y4E8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
USP15Q9Y4E8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP15Q9Y4E8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP15Q9Y4E8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP15Q9Y4E8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP15Q9Y4E8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP15Q9Y4E8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP15Q9Y4E8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP15Q9Y4E8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP15Q9Y4E8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP15Q9Y4E8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
USP15Q9Y4E8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms