Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBE2J1Q9Y385 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBE2J1Q9Y385 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBE2J1Q9Y385 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBE2J1Q9Y385 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
UBE2J1Q9Y385 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
UBE2J1Q9Y385 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBE2J1Q9Y385 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
UBE2J1Q9Y385 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBE2J1Q9Y385 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UBE2J1Q9Y385 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBE2J1Q9Y385 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UBE2J1Q9Y385 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
UBE2J1Q9Y385 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
UBE2J1Q9Y385 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBE2J1Q9Y385 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBE2J1Q9Y385 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBE2J1Q9Y385 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE2J1Q9Y385 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBE2J1Q9Y385 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBE2J1Q9Y385 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBE2J1Q9Y385 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBE2J1Q9Y385 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBE2J1Q9Y385 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UBE2J1Q9Y385 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UBE2J1Q9Y385 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBE2J1Q9Y385 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBE2J1Q9Y385 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBE2J1Q9Y385 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBE2J1Q9Y385 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
UBE2J1Q9Y385 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
UBE2J1Q9Y385 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
UBE2J1Q9Y385 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
UBE2J1Q9Y385 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE2J1Q9Y385 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE2J1Q9Y385 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE2J1Q9Y385 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE2J1Q9Y385 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE2J1Q9Y385 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE2J1Q9Y385 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE2J1Q9Y385 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE2J1Q9Y385 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE2J1Q9Y385 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE2J1Q9Y385 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE2J1Q9Y385 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE2J1Q9Y385 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE2J1Q9Y385 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE2J1Q9Y385 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE2J1Q9Y385 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE2J1Q9Y385 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE2J1Q9Y385 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE2J1Q9Y385 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE2J1Q9Y385 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE2J1Q9Y385 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE2J1Q9Y385 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE2J1Q9Y385 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE2J1Q9Y385 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE2J1Q9Y385 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE2J1Q9Y385 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE2J1Q9Y385 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE2J1Q9Y385 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE2J1Q9Y385 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE2J1Q9Y385 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE2J1Q9Y385 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE2J1Q9Y385 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBE2J1Q9Y385 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBE2J1Q9Y385 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBE2J1Q9Y385 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBE2J1Q9Y385 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBE2J1Q9Y385 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBE2J1Q9Y385 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBE2J1Q9Y385 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBE2J1Q9Y385 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBE2J1Q9Y385 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBE2J1Q9Y385 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBE2J1Q9Y385 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBE2J1Q9Y385 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBE2J1Q9Y385 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBE2J1Q9Y385 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBE2J1Q9Y385 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBE2J1Q9Y385 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBE2J1Q9Y385 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBE2J1Q9Y385 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBE2J1Q9Y385 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBE2J1Q9Y385 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBE2J1Q9Y385 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBE2J1Q9Y385 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBE2J1Q9Y385 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBE2J1Q9Y385 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
UBE2J1Q9Y385 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBE2J1Q9Y385 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBE2J1Q9Y385 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBE2J1Q9Y385 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBE2J1Q9Y385 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBE2J1Q9Y385 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBE2J1Q9Y385 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBE2J1Q9Y385 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBE2J1Q9Y385 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBE2J1Q9Y385 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBE2J1Q9Y385 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms