Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y343

SNX24, Sorting nexin-24, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX24Q9Y343 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SNX24Q9Y343 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SNX24Q9Y343 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SNX24Q9Y343 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNX24Q9Y343 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNX24Q9Y343 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNX24Q9Y343 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNX24Q9Y343 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNX24Q9Y343 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNX24Q9Y343 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNX24Q9Y343 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SNX24Q9Y343 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNX24Q9Y343 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SNX24Q9Y343 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNX24Q9Y343 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNX24Q9Y343 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNX24Q9Y343 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNX24Q9Y343 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNX24Q9Y343 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNX24Q9Y343 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNX24Q9Y343 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNX24Q9Y343 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SNX24Q9Y343 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SNX24Q9Y343 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SNX24Q9Y343 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SNX24Q9Y343 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNX24Q9Y343 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNX24Q9Y343 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNX24Q9Y343 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNX24Q9Y343 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNX24Q9Y343 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNX24Q9Y343 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNX24Q9Y343 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SNX24Q9Y343 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SNX24Q9Y343 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SNX24Q9Y343 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SNX24Q9Y343 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SNX24Q9Y343 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SNX24Q9Y343 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SNX24Q9Y343 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SNX24Q9Y343 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SNX24Q9Y343 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SNX24Q9Y343 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SNX24Q9Y343 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SNX24Q9Y343 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SNX24Q9Y343 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SNX24Q9Y343 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SNX24Q9Y343 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SNX24Q9Y343 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SNX24Q9Y343 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SNX24Q9Y343 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SNX24Q9Y343 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SNX24Q9Y343 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SNX24Q9Y343 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SNX24Q9Y343 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SNX24Q9Y343 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNX24Q9Y343 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNX24Q9Y343 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNX24Q9Y343 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNX24Q9Y343 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNX24Q9Y343 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNX24Q9Y343 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNX24Q9Y343 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNX24Q9Y343 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNX24Q9Y343 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNX24Q9Y343 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNX24Q9Y343 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNX24Q9Y343 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SNX24Q9Y343 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNX24Q9Y343 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNX24Q9Y343 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNX24Q9Y343 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNX24Q9Y343 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNX24Q9Y343 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SNX24Q9Y343 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNX24Q9Y343 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNX24Q9Y343 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SNX24Q9Y343 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNX24Q9Y343 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
SNX24Q9Y343 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNX24Q9Y343 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNX24Q9Y343 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNX24Q9Y343 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNX24Q9Y343 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNX24Q9Y343 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SNX24Q9Y343 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNX24Q9Y343 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNX24Q9Y343 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SNX24Q9Y343 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX24Q9Y343 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX24Q9Y343 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX24Q9Y343 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX24Q9Y343 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SNX24Q9Y343 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SNX24Q9Y343 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNX24Q9Y343 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNX24Q9Y343 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNX24Q9Y343 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNX24Q9Y343 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNX24Q9Y343 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.9 ms