Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2J2

EPB41L3, Band 4.1-like protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41L3Q9Y2J2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EPB41L3Q9Y2J2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EPB41L3Q9Y2J2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EPB41L3Q9Y2J2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EPB41L3Q9Y2J2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EPB41L3Q9Y2J2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EPB41L3Q9Y2J2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EPB41L3Q9Y2J2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EPB41L3Q9Y2J2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EPB41L3Q9Y2J2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EPB41L3Q9Y2J2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EPB41L3Q9Y2J2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EPB41L3Q9Y2J2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EPB41L3Q9Y2J2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EPB41L3Q9Y2J2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EPB41L3Q9Y2J2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EPB41L3Q9Y2J2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EPB41L3Q9Y2J2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EPB41L3Q9Y2J2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EPB41L3Q9Y2J2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EPB41L3Q9Y2J2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EPB41L3Q9Y2J2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EPB41L3Q9Y2J2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EPB41L3Q9Y2J2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EPB41L3Q9Y2J2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EPB41L3Q9Y2J2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EPB41L3Q9Y2J2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EPB41L3Q9Y2J2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EPB41L3Q9Y2J2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
EPB41L3Q9Y2J2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
EPB41L3Q9Y2J2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EPB41L3Q9Y2J2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EPB41L3Q9Y2J2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EPB41L3Q9Y2J2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EPB41L3Q9Y2J2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EPB41L3Q9Y2J2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EPB41L3Q9Y2J2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EPB41L3Q9Y2J2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EPB41L3Q9Y2J2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EPB41L3Q9Y2J2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EPB41L3Q9Y2J2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EPB41L3Q9Y2J2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EPB41L3Q9Y2J2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EPB41L3Q9Y2J2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EPB41L3Q9Y2J2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EPB41L3Q9Y2J2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EPB41L3Q9Y2J2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EPB41L3Q9Y2J2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EPB41L3Q9Y2J2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EPB41L3Q9Y2J2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EPB41L3Q9Y2J2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EPB41L3Q9Y2J2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EPB41L3Q9Y2J2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EPB41L3Q9Y2J2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EPB41L3Q9Y2J2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EPB41L3Q9Y2J2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EPB41L3Q9Y2J2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EPB41L3Q9Y2J2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EPB41L3Q9Y2J2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
EPB41L3Q9Y2J2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EPB41L3Q9Y2J2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EPB41L3Q9Y2J2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EPB41L3Q9Y2J2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EPB41L3Q9Y2J2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EPB41L3Q9Y2J2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EPB41L3Q9Y2J2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EPB41L3Q9Y2J2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EPB41L3Q9Y2J2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EPB41L3Q9Y2J2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EPB41L3Q9Y2J2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EPB41L3Q9Y2J2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EPB41L3Q9Y2J2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EPB41L3Q9Y2J2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EPB41L3Q9Y2J2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EPB41L3Q9Y2J2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
EPB41L3Q9Y2J2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EPB41L3Q9Y2J2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
EPB41L3Q9Y2J2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
EPB41L3Q9Y2J2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPB41L3Q9Y2J2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
EPB41L3Q9Y2J2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPB41L3Q9Y2J2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPB41L3Q9Y2J2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EPB41L3Q9Y2J2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EPB41L3Q9Y2J2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EPB41L3Q9Y2J2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EPB41L3Q9Y2J2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EPB41L3Q9Y2J2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EPB41L3Q9Y2J2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
EPB41L3Q9Y2J2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EPB41L3Q9Y2J2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EPB41L3Q9Y2J2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EPB41L3Q9Y2J2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EPB41L3Q9Y2J2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPB41L3Q9Y2J2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPB41L3Q9Y2J2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPB41L3Q9Y2J2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPB41L3Q9Y2J2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPB41L3Q9Y2J2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EPB41L3Q9Y2J2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms