Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF2

MAPK8IP1, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAPK8IP1Q9UQF2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
MAPK8IP1Q9UQF2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
MAPK8IP1Q9UQF2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MAPK8IP1Q9UQF2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MAPK8IP1Q9UQF2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
MAPK8IP1Q9UQF2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MAPK8IP1Q9UQF2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MAPK8IP1Q9UQF2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MAPK8IP1Q9UQF2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MAPK8IP1Q9UQF2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
MAPK8IP1Q9UQF2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MAPK8IP1Q9UQF2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
MAPK8IP1Q9UQF2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MAPK8IP1Q9UQF2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MAPK8IP1Q9UQF2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MAPK8IP1Q9UQF2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MAPK8IP1Q9UQF2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MAPK8IP1Q9UQF2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MAPK8IP1Q9UQF2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MAPK8IP1Q9UQF2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MAPK8IP1Q9UQF2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MAPK8IP1Q9UQF2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MAPK8IP1Q9UQF2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MAPK8IP1Q9UQF2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MAPK8IP1Q9UQF2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
MAPK8IP1Q9UQF2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MAPK8IP1Q9UQF2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MAPK8IP1Q9UQF2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MAPK8IP1Q9UQF2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MAPK8IP1Q9UQF2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MAPK8IP1Q9UQF2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MAPK8IP1Q9UQF2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MAPK8IP1Q9UQF2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MAPK8IP1Q9UQF2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MAPK8IP1Q9UQF2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MAPK8IP1Q9UQF2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MAPK8IP1Q9UQF2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MAPK8IP1Q9UQF2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
MAPK8IP1Q9UQF2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MAPK8IP1Q9UQF2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MAPK8IP1Q9UQF2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MAPK8IP1Q9UQF2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MAPK8IP1Q9UQF2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MAPK8IP1Q9UQF2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MAPK8IP1Q9UQF2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MAPK8IP1Q9UQF2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MAPK8IP1Q9UQF2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MAPK8IP1Q9UQF2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MAPK8IP1Q9UQF2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MAPK8IP1Q9UQF2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
MAPK8IP1Q9UQF2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MAPK8IP1Q9UQF2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MAPK8IP1Q9UQF2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MAPK8IP1Q9UQF2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MAPK8IP1Q9UQF2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MAPK8IP1Q9UQF2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MAPK8IP1Q9UQF2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MAPK8IP1Q9UQF2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MAPK8IP1Q9UQF2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MAPK8IP1Q9UQF2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MAPK8IP1Q9UQF2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MAPK8IP1Q9UQF2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MAPK8IP1Q9UQF2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MAPK8IP1Q9UQF2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MAPK8IP1Q9UQF2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MAPK8IP1Q9UQF2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MAPK8IP1Q9UQF2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MAPK8IP1Q9UQF2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MAPK8IP1Q9UQF2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MAPK8IP1Q9UQF2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MAPK8IP1Q9UQF2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MAPK8IP1Q9UQF2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MAPK8IP1Q9UQF2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MAPK8IP1Q9UQF2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MAPK8IP1Q9UQF2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MAPK8IP1Q9UQF2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MAPK8IP1Q9UQF2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MAPK8IP1Q9UQF2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MAPK8IP1Q9UQF2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MAPK8IP1Q9UQF2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MAPK8IP1Q9UQF2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MAPK8IP1Q9UQF2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
MAPK8IP1Q9UQF2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
MAPK8IP1Q9UQF2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
MAPK8IP1Q9UQF2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MAPK8IP1Q9UQF2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MAPK8IP1Q9UQF2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MAPK8IP1Q9UQF2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MAPK8IP1Q9UQF2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
MAPK8IP1Q9UQF2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MAPK8IP1Q9UQF2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MAPK8IP1Q9UQF2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MAPK8IP1Q9UQF2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MAPK8IP1Q9UQF2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MAPK8IP1Q9UQF2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MAPK8IP1Q9UQF2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MAPK8IP1Q9UQF2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MAPK8IP1Q9UQF2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MAPK8IP1Q9UQF2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MAPK8IP1Q9UQF2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms