Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULN7

PNMA8B, Paraneoplastic antigen-like protein 8B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8BQ9ULN7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PNMA8BQ9ULN7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PNMA8BQ9ULN7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PNMA8BQ9ULN7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PNMA8BQ9ULN7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PNMA8BQ9ULN7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PNMA8BQ9ULN7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PNMA8BQ9ULN7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PNMA8BQ9ULN7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PNMA8BQ9ULN7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PNMA8BQ9ULN7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PNMA8BQ9ULN7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PNMA8BQ9ULN7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PNMA8BQ9ULN7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PNMA8BQ9ULN7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNMA8BQ9ULN7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNMA8BQ9ULN7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNMA8BQ9ULN7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNMA8BQ9ULN7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PNMA8BQ9ULN7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PNMA8BQ9ULN7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PNMA8BQ9ULN7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PNMA8BQ9ULN7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PNMA8BQ9ULN7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PNMA8BQ9ULN7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PNMA8BQ9ULN7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PNMA8BQ9ULN7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PNMA8BQ9ULN7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PNMA8BQ9ULN7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PNMA8BQ9ULN7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PNMA8BQ9ULN7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PNMA8BQ9ULN7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PNMA8BQ9ULN7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PNMA8BQ9ULN7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PNMA8BQ9ULN7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PNMA8BQ9ULN7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PNMA8BQ9ULN7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PNMA8BQ9ULN7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PNMA8BQ9ULN7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PNMA8BQ9ULN7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PNMA8BQ9ULN7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PNMA8BQ9ULN7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PNMA8BQ9ULN7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PNMA8BQ9ULN7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PNMA8BQ9ULN7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PNMA8BQ9ULN7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PNMA8BQ9ULN7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PNMA8BQ9ULN7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PNMA8BQ9ULN7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PNMA8BQ9ULN7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PNMA8BQ9ULN7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PNMA8BQ9ULN7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PNMA8BQ9ULN7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PNMA8BQ9ULN7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PNMA8BQ9ULN7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PNMA8BQ9ULN7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNMA8BQ9ULN7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNMA8BQ9ULN7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNMA8BQ9ULN7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNMA8BQ9ULN7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNMA8BQ9ULN7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNMA8BQ9ULN7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNMA8BQ9ULN7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PNMA8BQ9ULN7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PNMA8BQ9ULN7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PNMA8BQ9ULN7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PNMA8BQ9ULN7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PNMA8BQ9ULN7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PNMA8BQ9ULN7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PNMA8BQ9ULN7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PNMA8BQ9ULN7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PNMA8BQ9ULN7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PNMA8BQ9ULN7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PNMA8BQ9ULN7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PNMA8BQ9ULN7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PNMA8BQ9ULN7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PNMA8BQ9ULN7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PNMA8BQ9ULN7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PNMA8BQ9ULN7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PNMA8BQ9ULN7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PNMA8BQ9ULN7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PNMA8BQ9ULN7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PNMA8BQ9ULN7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PNMA8BQ9ULN7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PNMA8BQ9ULN7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PNMA8BQ9ULN7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PNMA8BQ9ULN7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PNMA8BQ9ULN7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PNMA8BQ9ULN7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PNMA8BQ9ULN7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PNMA8BQ9ULN7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PNMA8BQ9ULN7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PNMA8BQ9ULN7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PNMA8BQ9ULN7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PNMA8BQ9ULN7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PNMA8BQ9ULN7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PNMA8BQ9ULN7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PNMA8BQ9ULN7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PNMA8BQ9ULN7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PNMA8BQ9ULN7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
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