Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
NRXN1Q9ULB1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
NRXN1Q9ULB1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
NRXN1Q9ULB1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
NRXN1Q9ULB1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
NRXN1Q9ULB1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
NRXN1Q9ULB1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
NRXN1Q9ULB1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
NRXN1Q9ULB1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
NRXN1Q9ULB1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
NRXN1Q9ULB1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
NRXN1Q9ULB1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC36.46■■■■□ 3.43
NRXN1Q9ULB1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
NRXN1Q9ULB1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC36.45■■■■□ 3.42
NRXN1Q9ULB1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
NRXN1Q9ULB1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
NRXN1Q9ULB1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
NRXN1Q9ULB1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
NRXN1Q9ULB1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC36.43■■■■□ 3.42
NRXN1Q9ULB1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
NRXN1Q9ULB1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
NRXN1Q9ULB1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
NRXN1Q9ULB1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
NRXN1Q9ULB1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
NRXN1Q9ULB1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
NRXN1Q9ULB1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
NRXN1Q9ULB1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
NRXN1Q9ULB1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
NRXN1Q9ULB1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
NRXN1Q9ULB1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
NRXN1Q9ULB1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
NRXN1Q9ULB1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
NRXN1Q9ULB1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
NRXN1Q9ULB1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
NRXN1Q9ULB1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
NRXN1Q9ULB1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
NRXN1Q9ULB1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
NRXN1Q9ULB1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC36.33■■■■□ 3.41
NRXN1Q9ULB1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
NRXN1Q9ULB1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
NRXN1Q9ULB1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
NRXN1Q9ULB1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
NRXN1Q9ULB1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
NRXN1Q9ULB1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
NRXN1Q9ULB1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
NRXN1Q9ULB1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
NRXN1Q9ULB1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
NRXN1Q9ULB1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
NRXN1Q9ULB1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
NRXN1Q9ULB1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
NRXN1Q9ULB1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
NRXN1Q9ULB1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
NRXN1Q9ULB1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
NRXN1Q9ULB1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
NRXN1Q9ULB1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC36.29■■■■□ 3.4
NRXN1Q9ULB1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
NRXN1Q9ULB1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
NRXN1Q9ULB1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
NRXN1Q9ULB1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
NRXN1Q9ULB1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
NRXN1Q9ULB1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
NRXN1Q9ULB1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
NRXN1Q9ULB1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
NRXN1Q9ULB1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
NRXN1Q9ULB1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
NRXN1Q9ULB1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
NRXN1Q9ULB1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
NRXN1Q9ULB1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
NRXN1Q9ULB1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
NRXN1Q9ULB1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
NRXN1Q9ULB1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
NRXN1Q9ULB1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
NRXN1Q9ULB1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
NRXN1Q9ULB1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
NRXN1Q9ULB1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
NRXN1Q9ULB1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
NRXN1Q9ULB1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
NRXN1Q9ULB1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
NRXN1Q9ULB1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
NRXN1Q9ULB1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
NRXN1Q9ULB1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
NRXN1Q9ULB1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
NRXN1Q9ULB1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
NRXN1Q9ULB1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
NRXN1Q9ULB1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
NRXN1Q9ULB1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
NRXN1Q9ULB1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
NRXN1Q9ULB1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
NRXN1Q9ULB1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
NRXN1Q9ULB1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
NRXN1Q9ULB1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
NRXN1Q9ULB1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
NRXN1Q9ULB1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC36.14■■■■□ 3.38
NRXN1Q9ULB1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
NRXN1Q9ULB1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
NRXN1Q9ULB1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
NRXN1Q9ULB1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
NRXN1Q9ULB1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
NRXN1Q9ULB1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
NRXN1Q9ULB1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms